São constituídas para melhorar o funcionamento da Assembleia Municipal, especialmente na preparação de melhores deliberações. O papel das Comissões traduz-se no exame preparatório dos assuntos e questões que são submetidos à Assembleia Municipal. São órgãos de estudo, emitem opiniões e podem formular propostas. Não têm poder de decisão. Mas podem dar opiniões e apresentar sugestões de melhoria. As reuniões das comissões não são públicas mas, a pedido do seu Presidente, e se necessário, podem ouvir personalidades qualificadas.

Na Sessão Ordinária de Junho, realizada no dia 25 de junho de 2026, foram estabelecidas as seguintes Comissões Permanentes:   

- Comissão de Desenvolvimento Económico, Finanças e Administração;
- Comissão de Urbanismo, Habitação, Ambiente, Transportes e Comunicações;
- Comissão de Educação, Cultura, Desporto e Juventude;
- Comissão Coesão Social, Saúde, Segurança e Proteção Civil.

No Mandato 2025-2029 será ainda constituida uma Comissão Eventual para Acompanhamento da Revisão do Plano Diretor Municipal da Amadora.